מועצת התלמידים של מנור נבחרת מדי שנה בתחילת שנת הלימודים, בבחירות חשאיות שבהן כל תלמיד/ה בוחר/ת נציג/ה משכבתו. המועצה מהווה ערוץ ישיר בין הקול של השכבות להנהלה.
מבנה המועצה
- יו"ר מועצת התלמידים — נבחר/ת משכבה ט׳
- שני נציגים מכל שכבה (ז׳, ח׳, ט׳)
- ועדות משנה: אירועים, קיימות, רווחת תלמידים
המועצה נפגשת אחת לשבועיים, מובילה יוזמות ואירועי שכבה, ומשתתפת בדיוני מדיניות שנוגעים לחיי היום-יום בבית הספר.